蛋白質二級結構的不斷發展
suizhehoujiyinzushidaidedaolai,yuelaiyueduodedanbaizhixuliebuduanbeifaxian,geidanbaizhideerjijiegouyanjiudailaijudadetiaozhanheyanjiukongjian。eryikaochuantongdeshiyanfangfahennanhuoqudaguimodanbaizhideerjijiegouxinxi。muqian,caiyongshengwuxinxixueshouduanrengranshihuodedabufendanbaizhierjijiegoudetujing。jinnianlai,xuduoyanjiuzhetongguogoujianyongyuerjijiegouyucededanbaizhishujuji,jisuan、tiqudanbaizhidegezhongtezhengxinxi,bingcaiyongbutongdeyucesuanfayucedanbaizhideerjijiegoudedaolekuaisudefazhan。benwennicongdanbaizhidetezhengxinxidetiquyushaixuan、預測算法以及預測效果的檢驗方法等方麵進行綜述,介紹蛋白質二級結構預測領域的研究進展。相信隨著基因組學、蛋白質組學和生物信息學的不斷發展,蛋白質二級結構預測會不斷取得新突破。
蛋dan白bai質zhi的de二er級ji結jie構gou是shi蛋dan白bai質zhi構gou建jian三san級ji結jie構gou和he發fa揮hui正zheng常chang功gong能neng的de基ji礎chu,故gu研yan究jiu蛋dan白bai質zhi的de二er級ji結jie構gou對dui於yu了le解jie蛋dan白bai質zhi的de三san級ji結jie構gou和he功gong能neng很hen重zhong要yao。隨sui著zhe後hou基ji因yin組zu時shi代dai的de到dao來lai,迅xun速su增zeng加jia的de蛋dan白bai質zhi序xu列lie信xin息xi與yu蛋dan白bai質zhi二er級ji結jie構gou研yan究jiu之zhi間jian的de差cha距ju越yue來lai越yue明ming顯xian。因yin此ci,采cai用yong生sheng物wu信xin息xi學xue手shou段duan研yan究jiu一yi種zhong能neng夠gou快kuai速su高gao效xiao地di分fen析xi蛋dan白bai質zhi的de二er級ji結jie構gou的de預yu測ce方fang法fa很hen有you必bi要yao。目mu前qian,預yu測ce蛋dan白bai質zhi的de二er級ji結jie構gou主zhu要yao基ji於yu如ru下xia兩liang個ge方fang麵mian。一yi是shi如ru何he有you效xiao地di獲huo取qu蛋dan白bai質zhi的de特te征zheng信xin息xi。在zai過guo去qu幾ji十shi年nian中zhong,許xu多duo研yan究jiu者zhe利li用yong不bu同tong的de特te征zheng信xin息xi來lai研yan究jiu蛋dan白bai質zhi的de二er級ji結jie構gou。其qi中zhong最zui常chang見jian的de就jiu是shi基ji於yu蛋dan白bai質zhi的de氨an基ji酸suan序xu列lie構gou建jian出chu的de特te征zheng信xin息xi.但(dan)也(ye)有(you)研(yan)究(jiu)者(zhe)指(zhi)出(chu),僅(jin)僅(jin)將(jiang)氨(an)基(ji)酸(suan)組(zu)成(cheng)作(zuo)為(wei)預(yu)測(ce)二(er)級(ji)結(jie)構(gou)的(de)特(te)征(zheng)信(xin)息(xi)會(hui)丟(diu)失(shi)蛋(dan)白(bai)質(zhi)的(de)一(yi)級(ji)結(jie)構(gou)特(te)征(zheng)信(xin)息(xi),即(ji)氨(an)基(ji)酸(suan)排(pai)列(lie)順(shun)序(xu)。蛋(dan)白(bai)質(zhi)二(er)級(ji)結(jie)構(gou)預(yu)測(ce)是(shi)蛋(dan)白(bai)質(zhi)結(jie)構(gou)組(zu)學(xue)研(yan)究(jiu)的(de)重(zhong)點(dian)問(wen)題(ti)之(zhi)一(yi),也(ye)是(shi)目(mu)前(qian)生(sheng)物(wu)信(xin)息(xi)學(xue)研(yan)究(jiu)中(zhong)的(de)重(zhong)要(yao)分(fen)支(zhi)領(ling)域(yu)。
蛋(dan)白(bai)質(zhi)二(er)級(ji)結(jie)構(gou)預(yu)測(ce)研(yan)究(jiu)經(jing)過(guo)數(shu)十(shi)年(nian)的(de)發(fa)展(zhan),加(jia)上(shang)蛋(dan)白(bai)質(zhi)相(xiang)關(guan)數(shu)據(ju)庫(ku)的(de)不(bu)斷(duan)擴(kuo)充(chong)和(he)完(wan)善(shan),現(xian)在(zai)該(gai)研(yan)究(jiu)領(ling)域(yu)已(yi)經(jing)越(yue)來(lai)越(yue)完(wan)善(shan)。但(dan)是(shi),蛋(dan)白(bai)質(zhi)二(er)級(ji)結(jie)構(gou)預(yu)測(ce)研(yan)究(jiu)仍(reng)然(ran)存(cun)在(zai)許(xu)多(duo)不(bu)足(zu)點(dian)。為(wei)了(le)更(geng)好(hao)地(di)預(yu)測(ce)蛋(dan)白(bai)質(zhi)的(de)二(er)級(ji)結(jie)構(gou),目(mu)前(qian)研(yan)究(jiu)者(zhe)越(yue)來(lai)越(yue)傾(qing)向(xiang)於(yu)將(jiang)各(ge)種(zhong)特(te)征(zheng)信(xin)息(xi)綜(zong)合(he)起(qi)來(lai)。雖(sui)然(ran)這(zhe)種(zhong)方(fang)式(shi)可(ke)以(yi)用(yong)更(geng)多(duo)的(de)特(te)征(zheng)信(xin)息(xi)來(lai)表(biao)示(shi)被(bei)預(yu)測(ce)的(de)蛋(dan)白(bai)質(zhi)。但(dan)如(ru)果(guo)特(te)征(zheng)信(xin)息(xi)過(guo)多(duo),同(tong)樣(yang)會(hui)造(zao)成(cheng)冗(rong)餘(yu)信(xin)息(xi)增(zeng)加(jia),引(yin)起(qi)特(te)征(zheng)維(wei)數(shu)過(guo)高(gao),勢(shi)必(bi)引(yin)起(qi)預(yu)測(ce)準(zhun)確(que)率(lv)不(bu)升(sheng)反(fan)降(jiang)的(de)效(xiao)果(guo)。蛋(dan)白(bai)質(zhi)的(de)二(er)級(ji)結(jie)構(gou)預(yu)測(ce)不(bu)僅(jin)取(qu)決(jue)於(yu)蛋(dan)白(bai)質(zhi)特(te)征(zheng)信(xin)息(xi)的(de)提(ti)取(qu),而(er)且(qie)與(yu)預(yu)測(ce)算(suan)法(fa)的(de)選(xuan)擇(ze)緊(jin)密(mi)相(xiang)關(guan)。當(dang)待(dai)測(ce)蛋(dan)白(bai)質(zhi)數(shu)據(ju)集(ji)中(zhong)蛋(dan)白(bai)質(zhi)的(de)序(xu)列(lie)相(xiang)似(si)度(du)很(hen)低(di)時(shi),預(yu)測(ce)算(suan)法(fa)及(ji)其(qi)參(can)數(shu)的(de)選(xuan)擇(ze)更(geng)加(jia)重(zhong)要(yao)。目(mu)前(qian),有(you)許(xu)多(duo)算(suan)法(fa)都(dou)被(bei)應(ying)用(yong)於(yu)蛋(dan)白(bai)質(zhi)的(de)二(er)級(ji)結(jie)構(gou)預(yu)測(ce)中(zhong)。中國糧油儀器網 http://www.98fo.cn/



